يُعد مسجد بانداراي كوتا كينابالو أهم ثاني مسجد في إقليم صباح، وقد تم افتتاحه في فبراير عام 2000م، بالقرب من بحر الصين الجنوبي يرسو المسجد على بحيرة صناعية، ويحيطه النخيل في منظر خلّاب؛ لذلك هو من أشهر الاماكن السياحية في كوتا كينابالو.
المسجد يعتبر من أهم أماكن السياحة في كوتا كينابالو، فهو تحفة معمارية يمتزج فيها فن العمارة الإسلامية التراثية مع الإبداع الهندسي، ويتشابه المسجد في تصميمه مع المسجد النبوي في بعض الفنون المعمارية، ويتميز بقبتيه الزرقاء والذهبية والتي تتواجد بالأكثر في منطقة الشرق الأوسط. تبلغ مساحة المسجد ما يقرب من 15 فدان، ويتسع لأكثر من 12 الف مُصلي، وأكثر زائري المسجد من العرب