تم تأسيس هذا المتحف سنة 1990 من أجل خدمة القرآن الكريم والعلوم المرتبطة به ليُصبح فيما بعد واحدًا من أشهر المتاحف الإسلامية نظرًا لوجود العديد من النُّسخ القرآنية والمخطوطات والتي تعود إلى خلافة عثمان بن عفان -رضي الله عنه-، ويضم المتحف مكتبة الفرقان الغنية بالكتب القيمة بلغاتٍ مختلفةٍ.
