يرجع تاريخ قلعة الجاهلي لنهاية القرن 19، وهي انعكاس لمدى أهمية مدينة العين بالنسبة لحكام الإمارات، فقد كانت مقراً صيفياً لإقامة الأسرة الحاكمة في أبو ظبي، وقد وقع الاختيار عليها من أجل الاستمتاع بالمياه النقية والرطوبة المنخفضة بدلاً من رطوبة الساحل المرتفعة.
تم إحاطة القلعة بجدار كبير في عام 1955، ولاحقاً أضيفت الثكنات ومباني أخرى إلى القلعة، وتم استخدامها لأغراض عسكرية حتى عام 1970، وفي عامي 2007 و 2008 تم اعتماد مشروع ضخم بهدف إعادة تأهيل القلعة، وكان ذلك بإقامة معرض مؤقت ومركز للمعلومات ومعرض دائم للمصور الإنجليزي ويلفرد ثيسجر، والآن قلعة الجاهلي واحدة من أبرز الأماكن السياحية في العين، وتتيح للزوار الاطلاع على الوثائق التاريخية وبعض المعدات الحربية التي تجسد جزء هام من تاريخ المدينة.